Klasifikasi pen marker adalah berdasarkan hujung pen mereka. Biasanya, pen marker boleh dibahagikan kepada hujung halus dan hujung lebar.
Pukulan yang dihasilkan oleh pen penanda hujung halus agak keras dan tajam, dengan warna seragam. Ia digunakan terutamanya untuk menggariskan dan melukis butiran kecil, seperti kawasan seperti titik dan seperti garis.
Hujung pen pen penanda hujung lebar adalah rata dan segi empat sama, yang merupakan jenis hujung pen klasik untuk pen penanda. Guratannya agak lembut, warnanya kaya dan penuh, dan corak dengan tekstur berbutir boleh dibuat. Disebabkan oleh banyak variasi dalam sudut bahagian hujung pen, variasi lejang yang terbentuk oleh hujung pen adalah agak ketara. Oleh itu, mereka kebanyakannya digunakan untuk beberapa pengisian dan salutan warna.
